Yanal delikli iğneli şırınga kullanarak preparasyonu kök kanalına yerleştirin. Toplam kanal uzunluğundan 2 mm daha kısa bir derinliğe yerleştirilmelidir, böylece iğnenin ucu kök ucunun çevresine girmelidir. İğne hiçbir koşulda kök kanalına takılmamalıdır. İrigasyon sıvısının kök ucunun ötesine zorlamaması gerektiğinden, uygulama sırasında şırınga pistonuna aşırı basınç uygulamayın. İğnenin ayrılmasını önlemek için Luer-lock şırınga kullanılması tavsiye edilir. Smear tabakasının etkili bir şekilde çıkarılması için preparatın 1-2 dakika kanalda kalması gerekir. Geniş apikal foramen durumunda (kök rezorpsiyonu, aşırı derecede genişlemiş veya olgunlaşmamış kök ucu) dikkatli bir şekilde sulayın.
Endoxal, sodyum hipoklorit ile reaksiyona giren ve kahverengi tortuları çökelten klorheksidin diglukonat içerir, bu nedenle, Endoxal'den hemen önce veya sonra sodyum hipoklorit kullanılması yasaktır. Kök kanal tedavisi sırasında sodyum hipoklorit kullanılmışsa, kök kanalı boşaltılmalı (örneğin kağıt koniler ile) ve saf su ile yıkanmalı ve tekrar boşaltılmalıdır.
